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崇基學院共有十所學生宿舍，可容納宿生共1,448人。十所宿舍各有特色，有約300位宿生的大宿舍，亦有約60位的小宿舍；除大部份標準雙人房，亦有標準三人房，以及少量特別三人房、四人房及單人房；有男生宿舍、女生宿舍及男女生宿舍可供選擇，宿舍設施包括大廳、廚房、活動室、自修室、音樂室、洗衣房等。宿生可自備路由器，於宿舍範圍內使用Wi-Fi服務，冷氣機及洗衣設備均可透過八達通卡系統操作。各宿舍簡介請參閱以下連結。
宿舍住宿期由每年九月初至翌年五月中旬，2025/26學年標準房間宿費為每人每學年16,826元，特別房間宿費為每人每學年13,460元，單人房宿費為每人每學年21,874元。
舊生申請宿舍日期為每年四月，新生則為八月下旬。同學屆時可留意學生宿舍委員會發出之電郵或參閱網頁資訊。
| 宿舍 | 男 | 女 | 合計 | 樓層 | 電梯 |
| 華連堂 | / | 99 | 99 | 3 | X |
| 利樹培堂 | 159 | 132 | 291 | 8 | O |
| 何善衡夫人宿舍 | 108 | 92 | 200 | 6 | X |
| 明華堂 | 67 | 41 | 108 | 4 | X |
| 五旬節會樓高座 | 105 | 106 | 211 | 10 | O |
| 五旬節會樓低座 | / | 203 | 203 | 10 | O |
| 神學樓 | 24 | 42 | 66 | 4 | O |
| 文質堂 | / | 111 | 111 | 5 | X |
| 文林堂 | 57 | / | 57 | 3 | X |
| 應林堂 | 102 | / | 102 | 3 | X |
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